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INFB  Bioinformatik I SGINF
Dozent : Prof. Dr. rer. nat. habil. Jörg Richard Weimar   eMail | Homepage
Semester4
Einordnung : Informatik Bachelor, Profil-Katalog B-INF-ProfilSWS4
Sprache : Deutsch/Englisch Art V Ü
Prüfungsart : PL  Credits
Prüfungsform : mündliche Prüfung 30 min 
Voraussetzungen :  
Querverweise : Hinweise zur Lehrveranstaltung 
Vorkenntnisse :  
Hilfsmittel und Besonderheiten :  
Lehrziele : Sequenzen, Algorithmen, Datenbanken 
Lehrinhalte :

Die klassische Bioinformatik beschäftigt sich mit der Speicherung, Verarbeitung und Analyse von DNA- und Aminosäuresequenzen. In dieser Vorlesung werden die grundlegenden Algorithmen und Programme hierzu vorgestellt: Exakte Textsuche, Scoring und Alignment, dynamische Programmierung, heuristische Verfahren (BLAST,dots), multiple Alignments, HMMs, RNA-Faltung, Genom-Assemblierung und Vergleich. Weiter werden die molekularbiologischen Datenbanken vorgestellt, die Datenorganisation diskutiert, und die Integration von Datenbanken (SRS, Protonet, ...). 

Literatur :  


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