INFB Bioinformatik I | SG | INF | |
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Dozent : |
Prof. Dr. rer. nat. habil. Jörg Richard Weimar eMail | Homepage |
Semester | 4 |
Einordnung : | Informatik Bachelor, Profil-Katalog B-INF-Profil | SWS | 4 |
Sprache : | Deutsch/Englisch | Art | V Ü |
Prüfungsart : | PL | Credits | 5 |
Prüfungsform : | mündliche Prüfung 30 min | ||
Voraussetzungen : | |||
Querverweise : | Hinweise zur Lehrveranstaltung | ||
Vorkenntnisse : | |||
Hilfsmittel und Besonderheiten : | |||
Lehrziele : | Sequenzen, Algorithmen, Datenbanken | ||
Lehrinhalte : | Die klassische Bioinformatik beschäftigt sich mit der Speicherung, Verarbeitung und Analyse von DNA- und Aminosäuresequenzen. In dieser Vorlesung werden die grundlegenden Algorithmen und Programme hierzu vorgestellt: Exakte Textsuche, Scoring und Alignment, dynamische Programmierung, heuristische Verfahren (BLAST,dots), multiple Alignments, HMMs, RNA-Faltung, Genom-Assemblierung und Vergleich. Weiter werden die molekularbiologischen Datenbanken vorgestellt, die Datenorganisation diskutiert, und die Integration von Datenbanken (SRS, Protonet, ...). | ||
Literatur : |